相对于其他的手游来说，《口袋妖怪3D》的宠物提升比较独特，不仅仅是简单的吃狗粮升级，吃魂魄/胆色/碎片等通用物品来升星级这种设置。宠物除了升级之外还有进化，虽然这个进化与升星其实差不多，都是进化一次之后属性有大幅度提升并激活高阶属性，但在《口袋妖怪3D》这个游戏里，与众不同的是进化素材的稀缺（好吧其实我来吐槽的），简直是太难弄到进化基因了好吧！！T_T神秘商店里每天只能买一个，这要凑到驴年马月才够我的宠物升级啊？难道是我的VIP级别不够高？
其实，进化基因除了可以通过刷任务和刷副本得到之外，还有两个重要途径。竞技场和宠物融灵，下面就简单说说我的心得。
竞技场是每天必须刷的，在玩家到达15级之后竞技系统就开了，可以挑战其他玩家。每天一共有10次的挑战次数，当次数消耗完之后，可以消耗一定量的钻石购买竞技次数(竞技次数也会自动恢复，每隔30分钟恢复一次)，VIP等级越高，可购买的次数越多，购买消耗的钻石数会递增。相应来说，收获也更丰厚，除了高级装备和进化基因之外，获得的徽章可以用来兑换装备和宠物，而兑换来的紫色宠物，如果好用就自己用，如果不好用，那就是进化基因的来源了，先留着。
到了17级，融灵系统开启，这个时候我们囤积的紫色宠物就派上用场了。在融灵之前先说一下，很多朋友看见紫色宠物就换上阵了，把蓝色宠物换下来消耗掉，其实这样做未必好用。宠物搭配，先看属性和攻防数据，再看进化用的花费。蓝色宠物进阶所耗用的资源要少很多，难度也简单，紫色宠物需要的东西就多很多，经常会卡在瓶颈上。因此建议如果升级紫色宠物，集中在一只上，把通用基因都留给它。而其他的蓝色宠物可以相对应升级，慢慢进化，也具有相当的战斗力。所以多余的紫色宠物不要可惜，留一两只就行，别的就不客气的融掉吧。
融灵系统一次可以放进5只紫色宠物进行融灵，得到灵晶和返还的经验。囤积灵晶，每天去神秘商店买进化基因，然后花钻石刷新，算起来每天可以拿到3个进化基因左右。这很不少了！！
此外还有一个是洗灵功能，相对于融灵来说，这个功能更多的是为了调整阵容用的。两套阵容都升级进化实在太土豪，我本人的做法是通常用一组搭配，另一组保持初始状态留着。当遇到某些属性比较克制的敌人时，就把主力阵容里需要更换的宠物拿去洗灵，返还所有的经验和进化物品，留给备用阵容的宠物用。当然，这么折腾需要花费一定钻石，但总比囤积两套阵容要节省很多。